南沙区属于南亚热带季风性海洋气候，暖和、多雨、湿润，夏长冬短，夏季时段赶过六个月。四季气候可概括为，夏无燥热，冬无严寒，春常阳雨，秋高气爽。年均匀气温22.6℃，最冷月均匀气温14.3℃（1月），最热月均匀气温28.9℃（7月），积年极度最高气温37.2℃（2016年7月9日），极度最低气温2.2℃（2016年1月24日）。雨质富足，分布不均，雨质相对会合正在汛期，年均匀雨质1673.1毫米，此中4～9月降雨质1354.9毫米，占全年降水质的81%。年均匀相对湿度为77%，最小相对湿度9%。全年日照1651.7小时，年均匀风速为2.1米/秒，最多风向东南偏南风。年蒸发质为1670.8毫米，年雷暴日数72.2天。夏秋常有热带气旋映响，均匀每年约有3～4个。
